Zusammenfassung der vollständigen Überprüfung
Zusammenfassung
YFull analysiert Y-Chromosomen und mtDNA zu einem günstigen Preis. Die Informationen sind jedoch auf diese Abschnitte des Genoms beschränkt.
7 Fakten aus unserem YFull Review
- Standort: Barcelona, Spanien
- Dienstleistungen: Hochladen von DNA-Daten und Interpretation von Y-DNA und mtDNA
- So funktioniert es: Laden Sie DNA-Rohdaten von anderen Unternehmen als BAM- oder VCF-Datei hoch, um Berichte zu erhalten.
- Berichte: Y-DNA- und mtDNA-Interpretation
- Datenschutz: Keine Weitergabe von Daten an Dritte ohne Zustimmung
- Kosten: $49 für die Y-DNA-Analyse, zusätzliche $25 für die mtDNA-Analyse
- Ergänzende Dienstleistungen: Nebula Genomics (30-fache Sequenzierung des gesamten Genoms, einschließlich Y-DNA und mtDNA)
Diese Bewertung wurde mit der Absicht geschrieben, so unvoreingenommen wie möglich zu sein. Sie stellt jedoch die Meinung eines einzelnen Rezensenten dar und ist daher subjektiv. Darüber hinaus bemühen wir uns bei Nebula Genomics, die Öffentlichkeit über die Vorteile der Gesamtgenomsequenzierung aufzuklären. Informationen zu unserem Whole Genome Sequencing DNA-Test sind daher in die Überprüfung integriert.
9. September 2022
Inhaltsverzeichnis
Herausgegeben von Christina Swords, Ph.D.
Vor-und Nachteile
Vorteile
- Keine Rechnungsstellung bis zum Vorliegen der Ergebnisse
- Keine Abonnementgebühren
- Zusätzliche Informationen über Ihre privaten Varianten.
- Sie können die Ergebnisse verschiedener NGS- oder Vollgenomtests miteinander vergleichen.
- YFull Groups kann alle STRs anzeigen und vergleichen
- Sie können SNP-Übereinstimmungen in YFull Groups für jede benannte oder unbenannte Variante finden
- Sie können andere Mitglieder und den Gruppenadministrator in Ihren YFull Gruppen kontaktieren
- Fragwürdige SNPs oder STRs aus Ihrem NGS-Test können bei YSEQ verifiziert und zu Ihren Ergebnissen hinzugefügt werden.
- Die Plattform unterstützt die Auswertung von mtDNA-Sequenzierungen
Nachteile
- Die STR-Analyse hat eine geringere Priorität als die SNP-Analyse und nimmt mehrere Wochen in Anspruch, wodurch sich der Erhalt der Interpretationsergebnisse verzögert.
- YTree aktualisiert monatlich
YVolle Einführung
YFull ist eine Website zum Hochladen von Y-Chromosom- und mitochondrialen DNA-Sequenzierungsdaten. Der Dienst bietet auch erweiterte Abstammungsanalysen. Neben anderen Angeboten verspricht es, „Ihre terminalen Haplogruppen und bekannten Y-SNPs freizuschalten“.
Einzelnukleotid-Polymorphismen oder SNPs (ausgesprochen „snips“) sind Unterschiede in DNA-Sequenzen auf der Ebene einzelner Basenpaare. Ein SNP ist im Wesentlichen ein Unterschied in einem einzigen DNA-Block (Nukleotid) zwischen Menschen.
Short Tandem Repeats (STRs) hingegen sind eine Reihe von sich wiederholenden DNA-Sequenzen (A, T, C oder G), die sich zwischen Individuen unterscheiden. Durch die Ermittlung der Anzahl der Wiederholungen in bestimmten Bereichen des Genoms kann ein „DNA-Fingerabdruck“ erstellt werden . Professionelle und Amateur-Genealogen können diesen Fingerabdruck verwenden, um die Abstammung einer Person zu untersuchen.
SNPs und STRs sind zusammen Marker, die vererbt werden können. Die Kombination solcher Marker ist als Haplotyp bekannt. Verschiedene Y-DNA- und mtDNA-Tests für unterschiedliche Haplotypen können Personen einer bestimmten „Haplogruppe“ zuordnen. Während Y-DNA-Tests mehr über die väterliche Linie aussagen können, geben mtDNA-Tests Aufschluss über die mütterliche Abstammung.
Mit YFull können Sie alles bis hinunter zu Ihrer terminalen Subklade, dem spezifischsten Zweig Ihrer Haplogruppe, nachschlagen.
YFull wurde 2013 in Moskau, Russland, mit dem speziellen Ziel gegründet, Y-Chromosom-Sequenzen zu interpretieren. Es ist wichtig anzumerken, dass es sich hierbei nicht um ein DNA-Testunternehmen handelt. Es handelt sich vielmehr um ein Analyseunternehmen, das die Auswertung von Sequenzierungen der nächsten Generation für Y-DNA und mtDNA anbietet.
Darüber hinaus bietet das Unternehmen eine bequeme Visualisierung der DNA-Ergebnisse und einen detaillierten, öffentlichen Haplogruppen-Yfull-Baum, mit dem Sie Ihren „Mutationspfad“ mit anderen Proben in der YFull-Datenbank vergleichen können.
Das ursprüngliche Team bestand aus Vadim Urasin, der seit 2008 aktiv an der DNA-Genealogie teilnimmt. Weitere Mitglieder des ursprünglichen Teams sind Vladimir Tagankin, der Entwickler der DNA-Datenbank „semargl.me“, und Roman Sychev, Moderator auf dna-forums.org.
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So laden Sie Ihre Daten auf YFull hoch
Beginnen wir die YFull-Überprüfung mit einem Überblick über den Service.
Um eine YFull-Testanalyse zu bestellen, müssen die Nutzer Rohdaten von anderen Anbietern genetischer Tests hochladen. Ihre Datei kann von mehreren Unternehmen stammen, einschließlich Nebula Genomics. Sie können die Kit-Nummern mit den YFull-IDs vergleichen, um den Zugriff zu erleichtern. Die Daten können als .BAM/.CRAM oder .VCF hochgeladen werden.
Eine Einschränkung: Die Datenextraktion aus VCF-Dateien ist unvollständig (etwa 50-70 %). Wenn ein Benutzer eine .VCF-Datei hochlädt, werden STR-Übereinstimmungen nicht gemeldet. YFull akzeptiert keine Daten im FASTQ-Format. Für optimale Ergebnisse ist daher der Upload einer .BAM-Datei erforderlich.
Schließlich können die Kunden bei der Bestellung einen Benutzernamen anlegen. Sie brauchen bei der Bestellung nicht zu bezahlen.
Nach einigen Wochen liegen die Ergebnisse vor und sind nach Zahlung von 49 $ verfügbar. Sie können eine mtDNA-Interpretation zu einem Aufpreis von $25 erwerben.
Überprüfung der YFull-Berichterstattung
Wie bereits erwähnt, gibt es zwei Arten von Y-DNA-Mutationen: SNPs und STRs. Beide Arten von Mutationen sind aus unterschiedlichen Gründen für die Untersuchung nützlich. YFull bietet eine Analyse sowohl von SNPs als auch von STRs.
Laut YFull gibt es 185.780 bekannte positive SNPs und 780+ bekannte STRs. Hinzu kommen 1 482 319 neue Varianten, die bisher noch nicht entdeckt worden sind.
Der Bericht über bekannte SNPs zeigt die Position des Kunden auf dem Y-Haplotree und die SNP-Ergebnisse für alle SNPs, die auf dem Baumzweig des Kunden getestet wurden. Zu den Details gehören Listen von SNPs in benachbarten Registerkarten, die Hervorhebung von „mehrdeutigen“ SNPs und SNPs ohne Call (d. h. SNPs, die während des Prozesses der Genotypisierung der DNA einer Person nicht bestimmt wurden).
Wir können auch eine Liste neuer oder privater SNPs einsehen. Diese neuartigen SNPs sind nach Qualität geschichtet (z. B. Best, Acceptable, Ambiguous, Low, One Reading).
Alle privaten SNPs haben ein YFS-Präfix. Das rote Häkchen neben einigen dieser SNPs bedeutet, dass sie über YSEQ überprüft werden können. Das G bezieht sich auf die Position dieses Gens innerhalb dieses SNP.
Der Bericht zeigt auch Insertionen und Deletionen (Indels), die Positionen in der Sequenz sind, die zusätzliche Nukleotide aufweisen.
Außerdem kann man auf SNP-Übereinstimmungen zugreifen. Dies sind SNPs, die mit anderen Proben in der YFull-Datenbank geteilt werden oder von denen angenommen wird, dass sie mit anderen Proben geteilt werden. Sie können diese SNPs auf einen entfernten gemeinsamen Vorfahren zurückführen.
Die Datenbank vergleicht weiterhin eine Probe, wenn sie aktualisiert wird. Wenn einer dieser privaten SNPs mit neu entdeckten YFull-Proben übereinstimmt, werden diese SNPs in der Y-Reihe benannt.
Man kann auch einzelne SNPs beobachten, um mehr Informationen zu erhalten. Dazu gehört die Anzahl der Reads, die diesen SNP überlappen, Referenzsequenzen usw.
Es gibt eine nützliche Funktion, mit der Kunden Ergebnisse nach SNP-Namen abfragen können.
Wir schließen unseren Überblick über die YFull-Berichterstattung mit einem Blick auf die YReport-Funktion. YTree enthält DNA-Haplogruppen und gemeinsame SNPs (Y-SNPs) in jedem Haplogruppen-Projekt. Sie basiert auf öffentlichen Stichprobendaten, einschließlich des 1000 Genomes Project.
YTree wird fast jeden Monat auf der Grundlage von Beiträgen von Haplogruppenexperten, der Internationalen Gesellschaft für genetische Genealogie (ISOGG) und anderen aktualisiert. Die Liste der SNPs von der Wurzel bis zur terminalen Haplogruppe kann gemeinsam genutzt werden.
Kunden können auch STR-Ergebnisse (780, die getestet werden), Übereinstimmungen und Varianten im gängigen 12-, 25-, 37-, 67- und 111-Format beobachten.
Zu den weiteren Merkmalen gehören Haplogruppen-Altersschätzungen, die auf einer Studie aus dem Jahr 2015 basieren, in der die Autoren eine originelle Methode zur Auswahl echter Mutationen beschreiben. Wenn die Rohdaten eines Kunden eine mtDNA-Sequenzierung enthalten, werden im Bericht mtDNA-Haplogruppen auf der Grundlage von PhyloTree aufgelistet. Im März 2019 führte die Plattform gegen eine zusätzliche Gebühr eine mtDNA-Analyse ein.
Weitere Dienstleistungen umfassen:
- Statistiken wie BAM-Dateigröße, zugeordnete Lesevorgänge, Längenabdeckung, mittlere Tiefenabdeckung und mehr (im YReport)
- CSV-Dateien (durch Kommas getrennte Dateien) für bekannte SNPs, neuartige SNPs und bekannte STRs
- Die Fähigkeit, Rohdaten nach Position zu durchsuchen (Genom baut hg19 oder hg38 auf)
- Meine Neuigkeiten: eine chronologische Auflistung der Änderungen an YTree seit Ihrem YFull-Beispiel (nach Aktualisierungen)
Überprüfung der YFull-Privatsphäre
Die Website ist Datenschutz-Bestimmungen erklärt, dass „YFull.com Ihre Privatsphäre respektiert und Ihre persönlichen Daten nicht ohne Ihre Zustimmung weitergibt“, sofern dies nicht gesetzlich vorgeschrieben ist.
In den Allgemeinen Geschäftsbedingungen sind keine Ausnahmen für Dritte vorgesehen. Das soll nicht heißen, dass keine Weitergabe an Dritte erfolgt, aber in der Richtlinie wird nicht darauf hingewiesen.
Im Anhang zu den Datenschutzbestimmungen wird die Vielfalt der gesammelten Nutzerdaten erörtert. Dies umfasst E-Mail-Adresse, Herkunftsinformationen und genetische Gendaten, Cookies und IP-Adresse.
Das YFull-Team hat vollständigen Zugang zu diesen Daten. Mitglieder von Gruppen, denen der Benutzer beigetreten ist, haben möglicherweise nur teilweisen Zugriff auf bestimmte Teile.
Citizen Science und akademische Forscher können diese Daten ebenfalls verwenden. Dies ist der Fall, wenn der Nutzer seine persönliche Zustimmung zur Teilnahme an einer Studie gegeben hat.
YFull speichert Ihre Daten auf einem Server, der sich in einem sicheren Rechenzentrum in Moskau, Russland befindet.
Google speichert einige Informationen, wie z. B. E-Mail-Adressen. Sie können Ihre Daten und Ihr Konto löschen, indem Sie auf die Seite „Einstellungen“ gehen.
YFull Bewertungen
Auf der Website des Unternehmens finden sich mehrere Kurzberichte. Abgesehen davon gibt es nicht viele zugängliche Kundenrezensionen im Internet.
Nebula Genomics
Wir beenden unseren YFull Test, indem wir uns einige ergänzende Produkte ansehen.
Unsere Daten können in YFull importiert werden, was den Zugang zu einer umfangreichen Y-Chromosomen- und Mitochondrien-DNA-Datenbank ermöglicht. Lesen Sie mehr im Blog, um mehr über die Bedeutung der Sequenzierung zu erfahren Y-DNA und mtDNA und Vaterschaftstests .
Andere DNA-Upload-Sites, die Sie möglicherweise überprüfen möchten, sind:
- DNA Land (kostenloser DNA-Upload zur Analyse von Merkmalen und Vorfahren)
- DNA-Maler (für die Genealogie – die erste ist kostenlos und Abonnements sind für andere verfügbar)
- GedMatch Genesis (kostenloser DNA-Upload und kostenpflichtige erweiterte Optionen)
- Genetischer Geist (kostenlos für die Gesundheitsberichterstattung)
- HomeDNA Ancestry (Migrationsgeschichte auf der Grundlage von Genpools)
- Lebende DNA (kostenloser Upload für Vorfahren)
- Mein Erbe (kostenloser Upload für Genealogie)
- MyTrueAncestry (lernen Sie Ihre Verbindung zu alten Völkern kennen)
- WeGene (ein Fokus auf asiatische Bevölkerung, Kosten für Berichte)
Sie können sich auch FamilyTreeDNA ansehen (Big Y-Ergebnisse, die einen STR-Test und einen SNP-Test enthalten).
Hat Ihnen unsere YFull-Bewertung gefallen? In unserem Blog können Sie weitere Bewertungen lesen, unter anderem zu einem Dienst namens YSEQ. Sehen Sie sich auch unseren vollständigen Leitfaden für das beste DNA-Testkit und andere Heimtests an.
